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课程的特色
本课为实操课,手把手教学。 主要是结合文献实例的学习和动手操作,循序渐进地带领大家认识数据库挖掘,面向于没有时间进行“湿实验”的临床医生,想通过科研提升竞争力的本科生,临床任务繁忙的专业型硕博,想结合数据挖掘的科研型硕博;对于基础研究不熟悉以及对各类分析语言不了解的人员。
课程大概
此系列课注重实用有效,关注无生信基础的研究人员挖掘公共数据的需求,重点讲解应用现有的实用在线网络工具、数据库做数据挖掘,完全零代码无编程。内容涵盖芯片测序数据挖掘,mRNA/miRNA/lncRNA/甲基化/肿瘤多组学/非编码RNA/肿瘤免疫浸润等研究热点。分析内容包括差异分析, 表达分析,相关性分析,预后分析,共表达分析等。同时结合文献应用案例,讲解如何实际的将所学工具应用到自己的文章中,配合操作演示,重现文献案例图表。 除此以外,讲解应用多个在线工具做数据挖掘的SCI文献案例,综合演练,重复文献实操演示。
5.课程目录
01-数据挖掘绪论
02- 芯片数据挖掘必备基础
03-RNA-seq数据挖掘必备基础
04-GEO数据库及在线分析
05-ArrayExpress数据库
06-TCGA数据库
07-Expression Atlas分析工具
08-UCSC_xena实操1
09-UCSC_xena实操2
10-cbioportal实操演示
11-TCGA实用在线挖掘工具(一)
12-TCGA实用在线挖掘工具(二)
13-LinkedOmics简介
14-LinkedOmics实操
15-LinkedOmics多组学分析及文章实例
16-预后基因挖掘工具及文章实例
17-甲基化预后挖掘工具及文章实例
18-肿瘤蛋白预后挖掘数据库
19-肿瘤蛋白数据挖掘
20-生存分析小工具
21-TCGA甲基化挖掘实用工具
22-肿瘤lncRNA挖掘工具
23-肿瘤miRNA挖掘工具
24-肿瘤预后分析工具及文章实例
25-oncomine分析.mp4
26-oncomine分析及文章实例.mp4
27-cdle数据库及文章实例.mp4
28-gene signature分析工具及文章实例.mp4
29-mirna signature分析工具及文章实例.mp4
30-肿组织与细胞系表达挖掘工具及文章实.mp4
31-canevolve综合挖掘tcga.mp4
32-实用肿瘤数据挖掘在线工具,mp4
33-hpa数据实操讲解.mp4
34hpa数据库文章实用案例.mp4
35-crn数据库及文章实例.mp4
36-芯片测序数据在线分析工具(一).mp4
37-生信分析文献导读与应用演示.mp4
38-在线工具分析公共na-seq数据演示.mp4
39-芯片测序数据在线分析工具(二).mp4
40-在线工具分析geo数据演示及文章实例.mp4
41-肿瘤免疫在线分析工具(一) .mp4
42-肿瘤免疫浸润分析文章实例.mp4
43-cibersoft免疫浸润分析及文章实例.mp4
44在线工具sci文章案例解读(一).mp4
45-3.9分sai文章还原演示mp4
46-在线工具sci文章案例解读(二).mp4
47-3.6分sci文章还原演示mp4
要代码数据挖掘.pdf